Zapalenie spojówek to częsta przyczyna wizyt zwierząt towarzyszących w gabinetach weterynaryjnych. Mimo że objawy kliniczne choroby u psów i kotów są ogólnie podobne, istnieją znaczące różnice w jej etiologii u tych dwóch gatunków zwierząt. U psów pierwotne zakażenia spojówek (w szczególności pierwotne bakteryjne) są stosunkowo rzadkie, a w większości przypadków zapalenie spojówek jest spowodowane innymi chorobami lub zaburzeniami, które indukują zapalenie oraz mogą przyczyniać się do wtórnego, oportunistycznego zakażenia bakteryjnego. U kotów z kolei niemal wszystkie przypadki zapalenia spojówek są spowodowane zakażeniem patogenem pierwotnym, przede wszystkim zaś herpeswirusem kocim (FHV-1). W efekcie postępowanie kliniczne, diagnostyczne oraz leczenie zapalenia spojówek u psów i kotów znacząco się różnią.